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二代测序

微生物特色服务

元基因组(宏基因组)测序

技术简介元基因组(宏基因组)学研究不要求对每个微生物进行分离、纯化和培养,而是直接从样品中提取基因组DNA后进行测序分析。通过元基因组测序,能够揭示微生物群落多样性、种群结构、进化关系、功能活性及环境之间的相互协作关系,极大地扩展了微生物学的研究范围。
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16S rRNA/ITS基因测序

技术简介指对环境细菌的16S rRNA和真菌的ITS基因序列进行高通量测序。细菌的16S rRNA基因和真菌的ITS基因结构既具有保守性,又具有高变性。通过测序结果与数据库比较,可以分析环境细菌/真菌的菌群结构和多样性。环境微生物多样性检测是指通过对环境中微生物16S rRNA/ITS高变区…
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微生物基因组测序

技术简介随着第二代高通量测序技术的迅猛发展,全基因组测序已经成为细菌基因组研究不可或缺的重要工具。第二代高通量测序技术大大降低了细菌基因组研究的成本,缩短了研究周期,为越来越多的科研人员提供了便利。微生物基因组测序根据客户需求可获得框架图、精细图和完成图。…
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RNA测序

非链特异性转录组测序

转录组(transcriptome)在广义上是指细胞内全部转录产物的集合,狭义上是指细胞中所有转录本(mRNA)的集合。转录组测序通常来说是指依托于高通量测序平台对细胞中的mRNAs进行测序。经过信息的整理和分析,可在不同的样本中挖掘具有意义的差异表达基因,研究可变剪切,融合基…
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链特异性转录组测序

非链特异性转录组测序信息不包含链方向的特征信息,对正义和反义转录本无法准确判断,导致无法反映真实的转录情况。而链特异性转录组测序(strand-specific RNA seq)可以解决这个问题。链特异性建库的方式是在合成cDNA的第二条链时,用dUTP替换dTTP。待链合成后,再用USER酶降…
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LncRNA-Seq

长链非编码RNA(Long non-coding RNAs, lncRNA)是一类长度超过200 nt且少有或不具有蛋白质编码潜能的复杂RNA,以带有polyA尾和不带有polyA尾两种形式广泛的存在于各类生物体内。……
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Small RNA Seq

小RNA是存在于生物体内的一类高度保守的RNA,序列的长度一般在18-32nt之间,小RNA包括了微小RNA(microRNA, miRNA),小干扰RNA(siRNA),核仁小RNA(snoRNA)和能与piwi蛋白互作的piRNA等。它们是各类生物生命活动中重要的调控因子,其作用与功能被研究的较为透彻…
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环状RNA测序

环状RNA(CircRNA),是相对于其他非编码RNA发现较晚的一类环状的、不具备或少具备编码能力的RNA,其广泛的存在于真核细胞的转录组中。环状RNA通常是在mRNA前体的可变剪切过程中,由上游外显子的5’端与下游外显子的3’端进行反向剪切而形成的……
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全转录组联合分析

全转录组,指的是特定细胞在某一状态下所有转录产物的集合,包括了mRNA和非编码RNA,例如lncRNA, miRNA,circRNA 等。随着近些年对于非编码RNA研究的不断深入,发现多种非编码RNA(lncRNA , circRNA)可作为竞争性内源RNA…
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单细胞测序

单细胞测序

技术简介随着测序技术不断发展以及测序成本的降低,使得基因组测序已经成为常规技术。通过提取组织或细胞群体的核酸进行基因组或转录组的研究,忽略了细胞间的差异对调控基因表达、细胞行为和药物反应的作用,已经不能满足研究人员的要求。因此单细胞测序(包括基因组和转录组测…
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全基因组测序

全基因组测序

技术简介全基因组测序分为从头测序(de novo sequencing)和重测序(re-sequencing)。从头测序(de novo)不需要任何参考基因组信息即可对某个物种的基因组进行测序,利用生物信息学分析方法进行拼接、组装,获得该物种的基因组序列图谱,从而推进该物种的后续研究。基因组重测序是…
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全外显子组测序

技术简介全外显子组测序是利用特异DNA序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕获并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。外显子组测序是检测蛋白质功能变异相关的遗传变异的重要手段。外显子组测序针对性强,相较于全基因组测序,具有测序数量少、测序深度高、检测到的突变更…
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其他

染色质免疫共沉淀测序

技术简介染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)也称结合位点分析法,是研究体内蛋白质与DNA相互作用的有力工具,通常用于转录因子结合位点或组蛋白特异性修饰位点的研究。将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效的在全基因组范围内检测与…
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数字表达谱分析(DGE)

技术简介数字基因表达谱(DGE)是研究某一物种特定组织在特定状态下的基因表达情况,能够全面、经济、快速地检测不同材料间的差异表达基因。
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RNA免疫共沉淀测序(RIP-Seq)

RNA结合蛋白免疫共沉淀测序技术(RIP-Seq)是研究细胞内RNA与其结合蛋白情况,了解转录后调控网络动态过程的前沿技术。其主要是利用针对特定蛋白的抗体对对应的RNA-蛋白质复合物进行沉淀,再分离复合物后提取结合在复合物上的RNA,并对其进行测序,分析和验证。RIP-Seq可用来了…
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