长链非编码RNA(long non-coding RNA,LncRNA)是一类长度大于200 nt且无或少有蛋白编码能力的复杂RNA,广泛存在于各种生物体内。以RNA形式在表观遗传学、转录及转录后等多种水平调控基因表达,在疾病的病理、生理过程中起着重要的调节作用。LncRNA测序服务,一次性获得样本中几乎全部的mRNA和LncRNA信息,为您全面、深入地研究LncRNA的功能提供了全新的工具。
技术路线
生物信息分析
案例解析
1.长链非编码RNA组成
转录组测序分析揭示肺癌样本中长链非编码RNA(LncRNA)的转录本长度分布及所在外显子的数量分布信息。
2.长链非编码RNA差异表达分析
小鼠红细胞组织特异性富集长链非编码RNA位点分析,揭示不同组织的表达差异水平。
3.环形RNA的组成和分布
文氏图揭示人体不同细胞间,线虫不同发育时期的环形RNA数量差异及人类环形RNA的基因组起源。
测序策略及数据量
测序策略:PE125 、 PE150 、PE250
数据量:一般测序8~10Gb
数据量:一般测序8~10Gb
技术优势
通过第二代高通量测序技术,可获得样本中几乎全部的LncRNA序列信息,不局限于对已知LncRNA的研究,还可对未知的LncRNA进行预测;
通过优化文库构建流程,使插入片段更长,更利于LncRNA的分析;同时减低了对RNA起始量 与质量要求;
数据分析不限于LncRNA,也可对环形RNA等非编码RNA进行分析;
个性化跟踪分析,让数据分析更有针对性,更加顺畅。
通过优化文库构建流程,使插入片段更长,更利于LncRNA的分析;同时减低了对RNA起始量 与质量要求;
数据分析不限于LncRNA,也可对环形RNA等非编码RNA进行分析;
个性化跟踪分析,让数据分析更有针对性,更加顺畅。